期刊简介
中华医学会主办，重庆医科大学第二临床学院病毒性肝炎研究所承办。本刊是全国性学术期刊，反映了肝脏疾病基础研究和临床实践的最新水平，报道了国内最新研究成果,介绍了国际学术动态,促进国际国内学术交流。内容包括肝脏疾病的病原学、流行病学、病理、病理生理、免疫学、发病机理、 临床诊断治疗及预防的实践经验和研究成果,以及新技术、新方法的重要进展。杂志适合县级以上医疗卫生机构从事肝病防治研究及临床实践的医务人员、预防和基础科研工作者阅读。
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首页>中华肝脏病杂志
- 杂志名称：中华肝脏病杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中华医学会
- 国际刊号：1007-3418
- 国内刊号：50-1113/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中国期刊全文数据库(CJFD)期刊收录：CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 万方收录(中), 上海图书馆馆藏, JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 国家图书馆馆藏, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 维普收录(中), 知网收录(中), 文摘与引文数据库, 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), CA 化学文摘(美)
肝癌相关差异表达基因的生物信息学分析
白文萱；高健；钱程；张献全
关键词：肝肿瘤, 差异表达基因, 免疫治疗靶点
摘要：目的 通过生物信息学方法分析肝癌发生相关差异表达基因,筛选肝癌早期诊断的分子标志物和免疫治疗的潜在分子靶点. 方法 从公共基因表达数据库(GEO)下载肝癌相关芯片数据,应用JMP软件进行GSE数据集相关性分析,使用R语言中的Limma程序筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行Gene Ontology (GO)功能富集分析、KEGG通路分析及蛋白相互作用调控网络构建.同时联合TCGA数据库中其他肿瘤RNA-seq转录组数据进行肝癌特异性表达分析,进一步筛选肝癌特异差异表达基因,并进行肝癌患者生存曲线分析. 结果 筛选出共有差异基因92个,其中上调基因21个,下调基因71个.通过GO、KEGG及蛋白相互作用网络分析,RNA-Seq数据验证发现,仅有磷脂酰肌醇蛋白聚糖3 (GPC3)在肝癌中表达上调,MBL2、SDS,SLCO1B3,TDO2、SAA4、SPP2在肝癌中特异性表达下调. 结论 GPC3可作为肝癌特异性的免疫治疗靶点,其他分子标志物有望成为肝癌早期检测的分子标志物和免疫治疗的潜在治疗靶标.
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